Anna Christina Kubitschek Barbará A. Pereira assumiu a direção do Memorial em outubro de 2000. O novo século estava chegando e o Memorial recebia agora uma injeção de juventude.

Anna Christina percebeu a necessidade de preparar o Museu para os novos tempos. Partindo do projeto original de Oscar Nierneyer, implementou a completa reforma do auditório que ficou mais leve e agradável, além da restauração do espelho d'água e suas cascatas há muito tempo desativadas. Em 21 de abril de 2001 foi inaugurada a nova iluminação externa do Memorial, realizada por meio do Projeto Reluz, que além de promover uma rigorosa revisão nas instalações elétricas e hidraúlicas, valorizou mais as formas da arquitetura do monumento.

o acervo foi reorganizado e informatizado, com um banco de dados completo, facilitando o acesso de estudantes e interessados em conhecer fatos históricos a respeito do Presidente Juscelino Kubitschek. Mais de 200 objetos foram incorporados à exposição permanente do Memorial. A renovação inclui a revisão das vitrines de exposição, a elaboração das galerias mais estruturadas e novos painéis que tornam a visita muito mais rica. Os modernos back-lights aumentaram a qualidade das fotografias em exposição e novos vídeos foram incorporados ao acervo do museu.

Houve um aumento substancial do número de publicações promovidas pela nova Presidência, como os novos folders, um portifólio sobre o trabalho de Dona Sarah, e o livro; 100 Anos da Vida e História de Juscelino Kubitschek, direcionado especialmente ao público infantil. Talvez em função da preocupação com as crianças podemos destacar, nos últimos
anos, um considerável aumento da visitação de escolas e grupos infantis ao museu.

Para comemorar o centenário do Presidente Juscelino Kubitschek, o artista Darlan Rosa distribuiu pelo jardim do Memorial, esculturas em forma de esferas poéticas feitas em aço carbono que remetem a fragmentos da história de Brasília.

Seguindo uma tendência verificada nos mais importantes museus do mundo, a partir de 2002 o memorial JK foi incorporado ao Projeto Música no Museu que visa a integração da música às artes plásticas e demais manifestações culturais. O projeto trouxe ao público da capital o que há de melhor na música brasileira.

Com o espaço revitalizado, o Memoríal JK reencontrou seu significado: continuar a multiplicar o repertório de imagens e de memória, ocupando seu papel estratégico na cultura e garantindo a conservação da história do Presidente Juscelino Kubitschek.